IDENTIFICACIÓN DEL NEMATODO AGALLADOR DE LA VID Y SUS PROTEÍNAS EFECTORAS USANDO MALDI TOF/TOF.

  • Jose Stalyn Cordova Campos Universidad Nacional de Tumbes
  • Segundo Alberto Urbina Astudillo INCA BIOTEC SAC
  • Pedro Miguel Masias Ramires INCA BIOTEC SAC
  • David Enrique Lindo Seminario, INCA BIOTEC SAC
  • Carlos Enrique Condemarin Montealegre Biotecoop
  • Savina Alejandra Gutiérrez Calle Biotecoop
  • Erick Antonio Suarez Peña Biotecoop
  • Virna Alexia Cedeño Escobar Biotecoop
  • Eric Louis Mialhe Matonnier Biotecoop

Resumen

Los nematodos agalladores de la raíz son los principales agentes patógenos que causan grandes pérdidas anuales en el rendimiento en muchos cultivos agrícolas. Estos nematodos secretan una mezcla de compuestos proteicos con diferentes funciones, conocidos como efectores, que estos patógenos necesitan para alcanzar el éxito en la infección. Actualmente, las nuevas herramientas moleculares nos han permitido conocer parcialmente diferentes tipos de efectores. Sin embargo, la diversidad de secuencias de proteínas efectoras de nematodos es poco conocido. En este estudio, caracterizamos molecularmente mediante el gen 18S ADNr amplificados por PCR al nematodo extraído de muestras radiculares del cultivo de vid y utilizamos la técnica de espectrometría de masas MALDI TOF/TOF para identificar y caracterizar la diversidad de secuencias de proteínas efectoras y no efectoras del nematodo en diferentes estadios. Los resultados de la secuenciación se logró obtener una longitud de 843 nucleótidos analizados por BLAST logrando identificar a Meloidogyne javanica con un porcentaje de 98% de identidad y un Query cover de 99%. Identificamos y caracterizamos 49 proteínas no efectoras y seis proteínas efectoras del nematodo, Beta-1,4-endoglucanas y polygalaturonasa para el segundo estadio, expansin B2, CLAVATA3/ESR, Pectato lyasa y Chorismato mutasa para el cuarto estadio. Este trabajo aporta la identificación de proteínas efectoras que el nematodo usa para lograr la infección de diversos tipos de hospederos. Palabras clave: Meloidogyne javanica, proteína efectora, espectrometría de masas MALDI TOF/TOF.

Publicado
2018-08-25
Sección
Resúmenes de Investigación